Die archäologische Stätte von Kolona befindet sich im Nordwesten der Insel, in der Nähe des Hafens und der modernen Stadt Aegina.
Der Hügel wurde nach den venezianischen Seefahrern Colonna (italienisch Colonna) genannt, die die Säulen des Apollo-Tempels, der ihn dominiert, als Orientierungspunkt nutzten. Colonna von Aegina ist bekannt für seine prähistorische Siedlung, eine der bedeutendsten dieser Zeit, sowie für den Apollo-Tempel aus dem 6. Jahrhundert v. Chr. Die prähistorische Stadt erlebte ihre Blütezeit in der Bronzezeit (2500-2600 v. Chr.) Das Heiligtum blühte im späten 6. bis frühen 5.
Die ersten Siedlungsreste auf dem Hügel von Kolona stammen aus dem späten Neolithikum. Seitdem haben verschiedene prähistorische Siedlungen (I-XI) das Gebiet bedeckt. Im 12. Jahrhundert v. Chr. hörte das städtische Leben auf zu existieren. Ab dem 10. Jahrhundert v. Chr. wurde der Hügel wieder als Wohngebiet genutzt, während die ersten Zeugnisse der Verehrung auf das 8. Jahrhundert v. Chr. zurückgehen, allerdings ohne die intensive Votivtätigkeit anderer Heiligtümer.
Im 7. Jahrhundert v. Chr. wurde der Hügel in ein Heiligtum, einen Ort der Götter, umgewandelt und zur Akropolis der Stadt, die in die Nähe des Hafens verlegt wurde. Zu Beginn des 6. Jahrhunderts v. Chr. wurden die ersten Gebäude für kultische Zwecke errichtet. Danach folgt die Hochsaison des Heiligtums. Eine letzte Blütezeit erlebte die Stadt während der hellenistischen Periode unter der Führung der Könige von Pergamon. Im 3. Jahrhundert n. Chr. wurde aufgrund von Barbarenüberfällen eine neue Befestigung aus dem Material der Heiligtumsgebäude errichtet. Nach der Verbreitung des Christentums wurden die noch erhaltenen Gebäude für andere Zwecke genutzt, und das Gebiet wurde bis zum Ende des ersten Jahrtausends erneut zu einer Siedlung umgewandelt, als die Siedlung aus Angst vor Überfällen vom Meer aus ins Innere der Insel (Paleochora) verlegt wurde.
Die ersten Ausgrabungen an diesem Ort wurden von Furtwaengler und Lolling durchgeführt. Von 1921 bis 1954 wurde die systematische Ausgrabung der prähistorischen Stadt und des Tempels durch G. Welter begonnen. Die Ausgrabungen wurden von 1966 bis 1992 von der Bayerischen Akademie mit Professor H. Walter fortgesetzt, der die prähistorische Stadt und die griechisch-römische Mauer ausgrub. Seit 1994 werden die Ausgrabungen von F. Felten im Auftrag der Österreichischen Archäologischen Schule weitergeführt.
Das Archäologische Museum von Aigina war das erste, das in Griechenland gegründet wurde.
Es wurde 1829 unter der Leitung von A. Moustoxydi gegründet. Das heutige Gebäude wurde 1980 an der Ausgrabungsstätte Kolona
errichtet und ist ein Geschenk der Bayerischen Sammlung der Freunde des Museums Ägina.
Es ist geplant, die Sammlung dauerhaft in das Kapodistrische Waisenhaus von Aigina zu überführen.